Il palazzo, costruito nel 1562-63, fu voluto dal cardinal legato Carlo Borromeo per raccogliere in unico edificio i vari insegnamenti dell'università bolognese.
(Testo)
S.CAROLO BORROMAEO HOC AEDIFICIUM IN HANC AMPLITUDINEM EREXIT IURISTARUM UNIVERSITAS GYMNASIUM IN CUSTODIAM SEIPSAM IN TUTELAM OPUS HOC IN HONOREM ET CULTUM D D